Struktur kaca silika lebur bersifat relaks, memungkinkan difusi ion gas tertentu melalui jaringannya pada suhu tinggi, di antaranya difusi ion natrium relatif cepat.
Sifat kaca silika lebur ini sangat penting bagi pengguna. Misalnya, ketika kaca silika lebur digunakan sebagai wadah suhu tinggi atau tabung difusi dalam industri semikonduktor, bahan semikonduktor menuntut kemurnian yang sangat tinggi. Oleh karena itu, bahan tahan api yang digunakan sebagai lapisan tungku yang bersentuhan dengan kaca silika lebur harus menjalani perawatan suhu tinggi dan pembersihan terlebih dahulu untuk menghilangkan kotoran alkali seperti kalium dan natrium sebelum ditempatkan di dalam kaca silika lebur untuk digunakan.
Pada suhu ruangan, kaca silika lebur dapat dianggap tidak dapat ditembus oleh gas. Bahkan pada suhu tinggi (misalnya, 700℃), konstanta permeabilitas gas tertentu sangat kecil. Oleh karena itu, dapat diterapkan pada peralatan suhu tinggi dan vakum tinggi.